Время подвижнических подвигов преподобного Трифона Вятского пришлось на годы святительства епископа Антония. После кончины в 1584 году епископа Варлаама I был избран на Вологодскую и Великопермскую кафедру игумен Дорогобужского монастыря Антоний, ближайший ученик и постриженник преподобного Герасима Болдинского († 1554). Воспитан он был в духе благочестия и строгой монашеской жизни. Епископскую хиротонию игумена Антония совершил митрополит Московский Дионисий 11 октября 1586 года. Хотя святительствовал владыка только два года, «но и в это непродолжительное время он своей отеческой заботой о благе пасомых, тихостью нрава и кротостью обращения, нелицемерным правосудием, радушием и милосердием к бедным снискал у всех большую любовь и уважение».
Тихая, мирная кончина святителя последовала 26 октября 1588 года. Смерть епископа Антония была для всех величайшей потерей и печалью. Более трех недель тело святителя не предавалось земле, пока для его погребения, по распоряжению Московского митрополита Иова, не прибыл из Ростова архиепископ Варлаам. Но и в столь продолжительное время честные останки его не подверглись тлению. По молитвам к святителю Антонию у его гроба стали совершаться чудеса и исцеления от недугов.
Мы ничего не знаем о происхождении святителя Маркелла, архиепископа Вологодского и Великопермского. Неизвестно его мирское имя, а также откуда он родом. Известно только, что в начале ХVII века пришел он на Соловецкие острова, в обитель преподобных Зосимы, Савватия и Германа. В 1640 году «достойнейший иеромонах Маркелл» был избран монастырской братией соловецким игуменом. На пятом году своего настоятельства игумен Маркелл был вызван в Москву, где совершилась его хиротония во епископа с возведением в сан архиепископа Вологодского и Великопермского.
Святитель Маркелл был высоко ценим Российскими государями. Его нередко приглашали к Царскому Двору в числе других иерархов для участия в решении важнейших церковно-государственных вопросов. Об этом, в частности, свидетельствует тот факт, что, когда в 1649 году в Новоезерском Кириллове монастыре чудесно обрели честные мощи преподобного Кирилла Новоезерского, Государь и Святейший Патриарх повелели святителю Маркеллу ехать в Новоезерский монастырь для их освидетельствования. В ноябре 1649 года, на обратном пути из Новоезерского монастыря, архиепископ Маркелл «по своему обещанью… поехал на Усть-Вым, Пермским чюдотворцем помолитись».
Паломничество архиепископа к мощам трех Пермских святителей – Герасима, Питирима и Ионы – продолжалось до июля. Путешествие было совершено водою на дощанике. Следствием того же благочестивого обета, который побудил архиепископа Маркелла к описанному путешествию, было построение в 1649–1653 годах в вологодском архиерейском дворе над Святыми вратами деревянной церкви во имя трех Пермских святителей.
В 1652 году архиепископ Маркелл принимал участие в торжествах общерусского масштаба – перенесении с Соловков в Москву честных мощей святителя Филиппа, митрополита Московского, бывшего игумена Соловецкого. Имя святителя Маркелла упоминается среди участников Церковных Соборов 1656 и 1660 годов.
Святитель Маркелл мирно почил 22 марта 1663 года, в Неделю Крестопоклонную Великого поста. Согласно завещанию, 5 июня 1663 года тело святителя было доставлено на Соловки и предано земле в стенах монастыря, в часовне преподобного Германа.
Время и место канонизации святителя Маркелла неизвестно.