Разорению и поруганию подверглось также и детище Белогорского монастыря – Фаворская Спасо-Преображенская пустынь в Еловской волости Осинского уезда.
В 1918 году, когда по Пермской губернии покатилась волна красного террора: был жестоко убит архиепископ Пермский и Кунгурский Андроник, а вслед за тем архимандрит Белогорского монастыря Варлаам (Коноплев) и множество монашествующих, наместник Фаворской пустыни архимандрит Ювеналий (Килин) вместе с братией обители скрылись от большевиков в лесах и близлежащих селениях. Красноармейцы, тем временем, наведались и в опустевшую Фаворскую обитель, где учинили погром и осквернили храмы.
6 марта 1919 года Осинский уезд, а с ним и волостной центр – село Елово были освобожден от большевиков армией Колчака. Еловский совет рабочих и крестьянских депутатов накануне своего бегства из села, возложил ответственность за сохранность монастырского имущества на местных крестьян, передав им Фаворскую пустынь «в бессрочное бесплатное пользование». После прихода белых архимандрит Ювеналий с братией вернулись в обитель. Монахи стали приводить в порядок разоренный монастырь, где вскоре состоялось повторное освящение храмов пустыни – Спасо-Преображенского собора, Казанской и Крестовоздвиженской церквей.
Но мирная жизнь в Фаворской пустыни продолжалась недолго – летом 1919 года Красная армия вновь заняла Пермскую губернию, а с ней и Осинский уезд. Архимандрит Ювеналий по благословению временно управляющего Пермской епархией епископа Чебоксарского Бориса (Шипулина) в июне 1919 года покинул Фаворскую пустынь и с отступавшими белыми войсками эвакуировался в в Читу, затем временно занимал должность настоятеля Верхнеудинского мужского монастыря, а 1 марта 1920 года переехал в Харбин. В Китае с отцом Ювеналием ушли белогорские иноки – иеромонах Петр (Семеновых) и иеромонах Иосиф.
9 сентября 1921 года Спасо-Преображенская Фаворская пустынь была «частично» ликвидирована, а 3 февраля 1922 года президиум губисполкома утвердил постановление об «окончательной» ликвидации обители и выселении монахов. Предметы, содержавшие драгоценные металлы, были конфискованы. Церковные принадлежности передали верующим церкви села Елово, а прочее «малоценное» имущество и земля перешли школе-коммуне № 1 «Искра».
Но далеко не все насельники Фаворской пустыни решились покинуть родную землю и переселиться на чужбину. Иные из них остались в советской России, где им предстояло пережить неминуемые гонения и репрессии.
В настоящее время на месте Спасо-Преображенской Фаворской пустыни расположился Еловский психоневрологический интернат.